[Gad]

На самом деле может, сходу трудно определить все последствия. Нужно будет как минимум разрешить финансовый отрицательный склад, чтобы не обработанное по Накладной количество из закупки могло быть списано складскими журналами (т.к. они формируют сразу финансовый склад). Кроме того, надо подумать о параметре Включать физическую стоимость для расчета мгновенной складской себестоимости.
Как процедура закрытия склада будет обрабатывать подобные операции я затрудняюсь сказать - в принципе закрытие склада не учитывает физическую себестоимость, а у нас никакой другой нет, следовательно, с расчетом корректной себестоимости тоже проблемы.
На самом деле я не в курсе стоящей задаче, но возможно стоит рассмотреть вариант использования вместо Заказов и Закупок складских журналов, например Прибыли\Убытки или например заказы использовать по полной - с Накладными, а приход делать складскими журналами. Тем более, что НДС, взаиморасчеты с контрагентами и прочие финансовые заморочки вас не интересуют.