Согласно методическим указаниям Минфина к ПБУ "Учет МПЗ":
"68. Фактическая себестоимость материалов, приобретенных за плату, включает:
- стоимость материалов по договорным ценам;
- транспортно - заготовительные расходы;
- расходы по доведению материалов до состояния, в котором они пригодны к использованию в предусмотренных в организации целях. "
К ТЗР в частности относятся суммы таможенных пошлин.
"83. Транспортно - заготовительные расходы (ТЗР) организации принимаются к учету путем:
а) отнесения ТЗР на отдельный счет "Заготовление и приобретение материалов", согласно расчетным документам поставщика;
б) отнесения ТЗР на отдельный субсчет к счету "Материалы";
в) непосредственного (прямого) включения ТЗР в фактическую себестоимость материала (присоединение к договорной цене материала, присоединение к денежной оценке вклада в уставный (складочный) капитал, внесенный в форме материально - производственных запасов, присоединение к рыночной стоимости безвозмездно полученных материалов и др.)."
то есть:
а) с использованием сч.15
б) на субсчет сч.10 (сч.41)
в) на сч.10/соответствующая категория запаса (сч.41/соответствующая категория товаров)
То есть если в учетной политике Вы не используете сч.15, то отнесение таможенной пошлины на 41 счет вполне допустимы, но ... в отчетном периоде. Скажем, если Вы уже оприходовали товар в январе, а платежка таможне пришла в феврале, то тут уж извините. Расходы относятся к тому отчетному периоду, в котором были фактически понесены (См. ПБУ "Расходы")
Далее по курсу учета МПЗ.
"19. Оценка запасов, стоимость которых при приобретении определена в иностранной валюте, производится в рублях путем пересчета суммы в иностранной валюте по курсу Центрального банка Российской Федерации, действующему на дату принятия запасов к бухгалтерскому учету."
При отражении сумм НДС, выраженных в иностранной валюте, в учете курс пересчета в рубли должен быть на дату соответствующего оправдательного документа. Однако дата счет-фактура не может отличаться от даты товаросопроводительного документа, хотя и может быть выписана в течении пяти дней (ст.168 п.3 НК РФ). Таким образом, курсы для принятия к учету товаров и НДС не могут отличаться.
P.S. На мой взгляд, если курсовые разницы учитывать на счетах отклонений очень проблематично с точки зрения обоснования перед МНС. Их лучше относить на сч.91