При создании заданий в классе WrkCtrJobLinkData_ReqJob методе load стоит такой кусочек:
X++:
_prodJobType = ProdJobType::construct(_reqRouteJob.JobType);
_calcTime = _prodJobType.calcWrkCtrHours(masterData.BOMCalcData(),
routeData.route(),
_routeOpr,
routeData.route(),
_routeOpr,
_reqTrans.ItemId,
_reqTrans.CovInventDimId
) * 3600;
_jobTime = _calcTime;
В prodJobType.calcWrkCtrHours во втором случае не передается рабочий центр и по умолчанию берется primaryOpr.WrkCtrId... у вас это видно группа РЦ.