1. про отходы (scrap) - проводки создаются, но товар приходуется и сразу списывается. важно - проводки списания из строки заказа не показываются, нужно через товар в проводки заходить или через все проводки.
2. про что-то /где-то/недавно/не помню - комментировать не буду
3. про кредит-ноту я уже написал выше - форма открывается на стандарте (= проверяйте/дебажьте вашу версию, стандарт работает)