Нет, никаких комплектов нет. Общался со специалистами, оказывается такая проблема существует и в других системах в случае, если по товару много перемещений с одного склада на другой. Может возникнуть ситуация с округлением, когда одна копейка перекидывается то в одну сторону, то в другую до момента достижения максимального количества итераций. А в итоге может так получится, что товар ушел со склада с правильной с\с, а пришел на другой с с\с, уменьшенной на копейку
На лицо баг, связываюсь с МБС.